微波干燥殺菌機主要應用于食品的干燥與殺菌。食品在深加工過程中，干燥與殺菌的工藝是不可避免的，基本上不用干燥的食品都必須用到殺菌。
殺菌設備也是有很多種方式，目前主要使用微波殺菌設備，微波干燥時候的時候可以起到殺菌的效果，但是食品殺菌的時候對食品的干燥起不到主要的作用，因為食品微波殺菌的時候只烘干5-10%的水分，所以食品烘干高水分的時候主要是干燥為目的。
微波干燥殺菌機的使用特點：
1、設備簡單，工藝：與常規(guī)消毒殺菌相比，微波殺菌設備不需要鍋爐、復雜的管道系統(tǒng)、煤場和運輸車輛等，只要具備水、電基本條件即可。
2、節(jié)約能源：常規(guī)熱力殺菌往往在環(huán)境及設備上存在熱損失，而微波是直接對食品進行作用處理，因而沒有額外的熱能損耗。相比而言，一般可節(jié)電30-50%。
3、便于控制：微波食品殺菌處理，設備能即開即用，沒有常規(guī)熱力殺菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率能從零到額定功率連續(xù)可調、傳輸速度從零開始連續(xù)調整，便于控制。
4、均勻：常規(guī)熱力殺菌是從物料表面開始，然后通過熱傳導傳至內部。存在內外溫差。為了保持食品風味，縮短處理時間，往往食品內部沒有達到足夠溫度而影響殺菌效果。由于微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內部都同時受到作用，所以消毒殺菌均勻、。
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