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細(xì)胞計(jì)數(shù)專(zhuān)題 | 熒光染料與自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀:?jiǎn)渭?xì)胞基因組學(xué)中可靠的核質(zhì)量評(píng)估

2025-6-21 閱讀(7)

在單細(xì)胞基因組學(xué)研究中,準(zhǔn)確評(píng)估細(xì)胞核質(zhì)量至關(guān)重要。將熒光染料與自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀等成像工具結(jié)合使用,是評(píng)估細(xì)胞核質(zhì)量的有效方法。在眾多熒光染料中,選擇組合以評(píng)估核質(zhì)量對(duì)于確保結(jié)果的可靠性至關(guān)重要。

此外,隨著現(xiàn)代自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀(如點(diǎn)成LUNA-FX7™點(diǎn)成LUNA-FL™)功能日益強(qiáng)大,深入了解這些系統(tǒng)在不同熒光染料組合下的表現(xiàn)顯得尤為必要。本研究旨在通過(guò)分析不同細(xì)胞類(lèi)型、不同系統(tǒng)以及核固定條件下的熒光染料組合,找出的評(píng)估核質(zhì)量的方法。我們希望通過(guò)全面的分析,為單細(xì)胞基因組學(xué)研究中的核質(zhì)量評(píng)估程序提供優(yōu)化指導(dǎo)并提高評(píng)估的準(zhǔn)確性。

1. 材料與方法

本研究使用了四種不同的熒光染料,且每種染料的最終濃度均有所不同:28 µM的嘧啶橙(AO),12.5 µM的鈣黃素(AM),15 µM的碘化丙啶(PI),以及20 µM的EthD-1。這些染料組合成AO/PI、AO/EthD-1、Calcein AM/PI和Calcein AM/EthD-1四種染料。每種組合取各染料1µL,總體積為2µL,隨后與18 µL細(xì)胞樣本混合。

2. 核質(zhì)量評(píng)估的熒光染料組合

實(shí)驗(yàn)旨在找出的染料組合,使用不同熒光染料評(píng)估U937細(xì)胞核和3T3細(xì)胞核的質(zhì)量。理論上,完整的細(xì)胞應(yīng)僅被膜透性染料(如AO和Calcein AM)選擇性染色。而去除膜后的分離細(xì)胞核則應(yīng)被非膜透性染料(如PI和EthD-1)染色,顯示出與死亡細(xì)胞類(lèi)似的活性狀態(tài)。
在AO/PI、AO/EthD-1、Calcein AM/PI和Calcein AM/EthD-1這四種染料組合中,AO與PI或AO與EthD-1的組合能夠準(zhǔn)確顯示完整細(xì)胞和分離細(xì)胞核的活性(圖1A)。綠色和紅色信號(hào)的存在,使其能夠有效檢測(cè)U937細(xì)胞和3T3細(xì)胞的活性。然而,在3T3細(xì)胞中幾乎沒(méi)有檢測(cè)到Calcein AM信號(hào),而在U937細(xì)胞中約有三分之二的細(xì)胞顯示出Calcein AM信號(hào)(圖1B)。這種差異可以歸因于Calcein AM對(duì)酯酶活性的依賴(lài)性,而酯酶活性可能因不同細(xì)胞類(lèi)型而異。因此,使用Calcein AM會(huì)遺漏部分完整細(xì)胞,從而降低活性評(píng)估的可靠性。

圖1.(A) 使用AO和PI組合以及AO和EthD-1組合對(duì)U937細(xì)胞和3T3細(xì)胞的染色結(jié)果。(B)使用Calcein AM和PI組合以及Calcein AM和EthD-1組合對(duì)U937細(xì)胞和3T3細(xì)胞的染色結(jié)果。

3. 定量核質(zhì)量評(píng)估

點(diǎn)成LUNA-FX7™點(diǎn)成LUNA-FL™系統(tǒng)是功能強(qiáng)大的分析平臺(tái),能夠無(wú)縫捕獲明場(chǎng)圖像和熒光圖像,并通過(guò)熒光信號(hào)分析獲得細(xì)胞大小、活性和數(shù)量等寶貴數(shù)據(jù)。

評(píng)估分離核質(zhì)量時(shí),可利用這些系統(tǒng)提供的平均細(xì)胞大小數(shù)據(jù)。例如,去除膜后的細(xì)胞核尺寸顯著小于完整細(xì)胞,這是因?yàn)槿コ?xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)會(huì)使細(xì)胞大小減少數(shù)微米。特別的是,點(diǎn)成LUNA-FL™點(diǎn)成LUNA-FX7™能夠從明場(chǎng)圖像中提取細(xì)胞大小信息,因此能地避免因熒光強(qiáng)度可能引起的細(xì)胞大小測(cè)量偏差。這確保了在評(píng)估分離核質(zhì)量時(shí),細(xì)胞大小測(cè)量的可靠性更高。

采用熒光染料檢測(cè)細(xì)胞活性是核質(zhì)量評(píng)估的另一個(gè)有用數(shù)據(jù)。如圖1所示,當(dāng)使用AO/PI或AO/EthD-1組合時(shí),健康的完整細(xì)胞顯示接近99%的活性,而分離核顯示接近0%的活性值。像點(diǎn)成LUNA-FL™點(diǎn)成LUNA-FX7™這樣的自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀能夠在這些染料的作用下,準(zhǔn)確量化分離核的濃度(圖2)。這些結(jié)果提供了重要數(shù)據(jù),驗(yàn)證了核質(zhì)量,為后續(xù)應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

圖2. 顯示使用不同染料組合(AO/PI和AO/EthD-1)對(duì)U937細(xì)胞和3T3細(xì)胞染色結(jié)果的拼接圖。圖中還展示了來(lái)自點(diǎn)成LUNA-FX7™(A)和點(diǎn)成LUNA-FL™(B)的定量分析結(jié)果。

4. PFA固定后的核染色

核固定是長(zhǎng)期保存的常見(jiàn)操作,因?yàn)樗兄诒4婕?xì)胞結(jié)構(gòu)并便于后續(xù)分析。因此,為驗(yàn)證上述核質(zhì)量評(píng)估方法是否適用于固定的核,我們使用AO/PI和AO/EthD-1對(duì)PFA固定的核進(jìn)行測(cè)試。使用AO/PI染料組合時(shí),無(wú)論固定狀態(tài)或染料培養(yǎng)時(shí)間如何,均可觀察到明顯且強(qiáng)烈的PI熒光信號(hào),這表明AO/PI染料可用于新鮮的分離核和固定核分析。然而使用AO/EthD-1時(shí),固定核的EthD-1紅色熒光信號(hào)減少,即使延長(zhǎng)染料培養(yǎng)時(shí)間,熒光信號(hào)也沒(méi)有增加。為解決這一問(wèn)題,我們調(diào)整了自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀的曝光值,將其從默認(rèn)的5增加到8。這一調(diào)整產(chǎn)生了更強(qiáng)的紅色信號(hào),與AO/PI組合的效果相當(dāng)。這些結(jié)果表明,使用AO/EthD-1染料時(shí),固定核的熒光信號(hào)會(huì)有所減弱,因此可能需要調(diào)整自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀的參數(shù)。

圖 3. 顯示使用AO/PI和AO/EthD-1對(duì)核在PFA固定前后染色結(jié)果的拼接圖。右側(cè)還展示了使用曝光設(shè)置為8時(shí)獲得的圖像。

結(jié)論

在快速發(fā)展的單細(xì)胞基因組學(xué)研究領(lǐng)域,精確評(píng)估核質(zhì)量是實(shí)現(xiàn)可靠研究結(jié)果的基石。研究評(píng)估的染料組合中,AO/PI和AO/EthD-1在區(qū)分完整細(xì)胞與分離核的活性差異方面表現(xiàn)出色。值得注意的是,AO/PI對(duì)新鮮核和固定核均表現(xiàn)出良好的效果,而AO/EthD-1在固定核的應(yīng)用中需要優(yōu)化。本研究通過(guò)結(jié)合適當(dāng)?shù)娜玖辖M合與的點(diǎn)成LUNA-FX7™點(diǎn)成LUNA-FL™系統(tǒng),提出了一種高效且可靠的分離核質(zhì)量評(píng)估方法。這一成熟的方法為核質(zhì)量評(píng)估提供了寶貴的技術(shù)手段,從而推動(dòng)了單細(xì)胞基因組學(xué)研究的進(jìn)步。

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